Voor het uitgaventerrein onderzoek, energie en vervoer concludeert de Rekenkamer dat, ondanks enkele verbeteringen, het toezicht en de controle van de Commissie slechts ten dele het risico van te hoog opgegeven indirecte kosten (overheadkosten) en personeelskosten kunnen ondervangen, hoofdzakelijk vanwege de complexe regelgeving, die een groot aantal subsidiabiliteitscriteria kent.
In Bezug auf die in den Themenkreis Forschung, Energie und Verkehr fallenden Ausgaben gelangt der Hof zu dem Schluss, dass das Risiko einer überhöhten Angabe von indirekten Kosten (Gemeinkosten) und Personalkosten durch die Überwachungs- und Kontrollsysteme der Kommission - trotz einiger Verbesserungen - nur bedingt abgeschwächt wird. Hauptursache hierfür ist der komplexe Rechtsrahmen mit zahlreichen Förderkriterien.