In de conclusies van Thessaloniki werd bovendien de Commissie gevraagd na te gaan of het noodzakelijk was nieuwe institutionele mechanismen in het leven te roepen om de operationele samenwerking bij het beheer van de buitengrenzen te versterken. Daaronder valt ook de verwezenlijking van een Europese operationele structuur.
In den Schlussfolgerungen von Thessaloniki wurde außerdem die Kommission ersucht zu prüfen, ob neue institutionelle Mechanismen zur Verstärkung der operativen Zusammenarbeit beim Grenzschutz an den Außengrenzen, möglicherweise auch eine operative Struktur der Gemeinschaft, geschaffen werden müssen.