Het EFRO moet tevens de specifieke problemen aanpakken waarmee bepaalde eilanden, en de autonome steden Ceuta en Melilla met een grote bevolkingsdichtheid en hoge werkloosheidscijfers, berggebieden en dunbevolkte gebieden die door hun geografische ligging in hun ontwikkeling worden geremd, te kampen hebben.
Le FEDER traite aussi les difficultés spécifiques rencontrées par certaines îles, par les villes autonomes de Ceuta et Melilla, qui ont une forte densité démographique et des taux de chômage élevés, et par certaines régions montagneuses et régions faiblement peuplées, résultant de leur situation géographique et qui ralentissent leur développement.