In tegenstelling tot de NAFO-regeling (Visserijorganisatie voor het noordwestelijk deel van de Atlantische Oceaan) waarvoor de controle en rechtshandhaving uit de Gemeenschapsbegroting worden gefinancierd, stelt de Commissie voor dat de lidstaten de lasten voor de uitvoering van de NEAFC-regeling dragen (ter beschikking stellen van inspecteurs en inspectievaartuigen, dragen van investerings- en werkingskosten, enz.).
Contrairement au système en vigueur dans le cadre de la NAFO (Organisations des pêches de l'Atlantique du nord-ouest), selon lequel les mesures de contrôle et de coercition sont financées sur le budget de la Communauté, la Commission propose que les Etats membres assument la mise en œuvre du schéma de la CPANE (mise à disposition d'un inspecteur et de navires d'inspection, prise en charge des coûts d'investissements et de fonctionnement, etc.).