Dat komt in de eerste plaats omdat er geen onderscheid wordt gemaakt tussen de verschillende categorieën die onder Natura 2000 vallen, bijvoorbeeld tussen enerzijds bossen en plattelandsgebieden – dit is het grootste gedeelte - waar de grond wordt bebouwd of waar sprake is van een bepaalde beschermde habitat, en anderzijds rivieren, de zee en waterbodems.
Premièrement, parce qu’il n’opère pas de distinction entre les différentes catégories couvertes par Natura 2000: par exemple, entre les forêts et les terres agricoles - la grande majorité - où la terre est cultivée ou un environnement naturel protégé, par opposition aux rivières, à la mer et aux fonds marins.