De bepalingen van het protocol zijn van toepassing op : zoet oppervlaktewater; grondwater; estuaria; kustwateren die worden gebruikt voor recreatie of voor de productie van vis door middel van aquacultuur of voor de productie of oogst van schaaldieren; ingesloten wateren, algemeen beschikbaar voor baden; water tijdens het winnen, vervoeren, behandelen of leveren; afvalwater gedurende het gehele traject van verzamelen, vervoeren, behandelen en afvoeren of hergebruiken.
Les dispositions du protocole s'appliquent : aux eaux douces superficielles; aux eaux souterraines; aux estuaires; aux eaux côtières utilisées à des fins récréatives, ou pour l'aquaculture ou la conchyliculture; aux eaux fermées généralement disponibles pour la baignade; aux eaux au cours des opérations de prélèvement, de transport, de traitement ou d'approvisionnement; aux eaux usées tout au long des opérations de collecte, de transport, de traitement et de rejet ou de réutilisation.