In de praktijk moeten het Parlement, de Raad en de Commissie evenwel een Interinstitutioneel Akkoord (IIA) sluiten over de begrotingsdiscipline en de verbetering van de begrotingsprocedure waarin het meerjarig financieel kader en de wijze van toepassing (deel I) worden vastgelegd, alsmede de regels ter verbetering van de interinstitutionele samenwerking in het algemeen en met betrekking tot meer specifieke onderwerpen als de indeling van de uitgaven, de rechtsgronden enz (deel II).
Mais en pratique, le Parlement, le Conseil et la Commission doivent conclure un Accord interinstitutionnel (AII) sur la discipline et l'amélioration de la procédure budgétaire qui définit le cadre financier pluriannuel et ses modalités d'application (partie I) ainsi que les règles se rapportant à l'amélioration de la collaboration interinstitutionnelle en général et à des sujets plus spécifiques comme la classification des dépenses, la question des bases légales, etc (partie II).