Het is zeer wel mogelijk dat er situaties bestaan waarin aalscholvers een ernstig risico vormen voor bedreigde vissoorten, en het stelsel van afwijkingen is ook in deze context toepasbaar, aangezien er een expliciete bepaling in de vogelrichtlijn is opgenomen voor het gebruik van afwijkingen “ter bescherming van flora en fauna”.
À l’instar de certaines situations dans lesquelles les cormorans représentent un grave danger pour les espèces menacées de poissons, le système de dérogation s’applique également dans ce contexte étant donné qu’une disposition de la directive Oiseaux autorise le recours aux dérogations «pour la protection de la flore et de la faune».