EFRO wordt uitgevoerd op het nationale niveau door middel van zevenjarige programma’s als deel van een partnerschapsovereenkomst met de EU, waarbij de vijf Europese structuur- en investeringsfondsen (ESI-fondsen) betrokken zijn: EFRO, Europees Sociaal Fonds (ESF), Cohesiefonds, Europees Fonds voor maritieme zaken en visserij (FMZV) en Europees Landbouwfonds voor plattelandsontwikkeling (Elfpo).
Le FEDER est mis en œuvre au niveau national au moyen de programmes septennaux dans le cadre d’un accord de partenariat avec l’UE, qui implique cinq Fonds structurels et d’investissement européens (Fonds ESI): le FEDER, le Fonds social européen (FSE), le Fonds de cohésion, le Fonds européen pour les affaires maritimes et de la pêche (FEAMP) et le Fonds européen agricole pour le développement rural (Feader).