L'abattoir doit aussi prêter l'attention nécessaire au monitoring des contaminants microbiologiques (agents zoonotiques) ainsi qu'aux indicateurs de l'hygiène d'abattage.
Ook het slachthuis dient de nodige aandacht te besteden aan de monitoring van microbiologische contaminanten (zoönoseverwekkers) evenals indicatoren van de slachthygiëne.