Étant donné que le pantoprazole se lie à l'enzyme distale par rapport au niveau des récepteurs cellulaires, il peut inhiber la sécrétion d’acide chlorhydrique indépendamment de la stimulation par d’autres substances (acétylcholine, histamine, gastrine).
Aangezien pantaprozol zich bindt aan het enzym distaal van het celreceptor niveau, kan het de maagzuursecretie remmen onafhankelijk van de stimulatie door andere stoffen (acetylcholine, histamine, gastrine).