La prudence est recommandée en cas d'administration conjointe de citalopram avec des médicaments principalement métabolisés par cette enzyme et dont l'indice thérapeutique est étroit, par exemple la flécaïnide, la propafénone et le métoprolol (lorsqu'ils sont utilisés en cas d'insuffisance cardiaque) ou avec certains médicaments agissant sur le SNC et principalement métabolisés par le CYP2D6, comme les antidépresseurs tels que la désipramine, la clomipramine et la nortryptyline ou les antipsychotiques comme la rispéridone, la thioridazine et l'halopéridol.
Voorzichtigheid is geboden bij gelijktijdige toediening van citalopram met geneesmiddelen die vooral door dat enzym worden gemetaboliseerd en een smalle therapeutische index hebben, bv. flecaïnide, propafenon en metoprolol (bij gebruik bij hartfalen) of sommige geneesmiddelen die inwerken op het CZS en vooral worden gemetaboliseerd door CYP2D6, bv. antidepressiva zoals desipramine, clomipramine en nortriptyline of antipsychotica zoals risperidon, thioridazine en haloperidol.