Le métabolisme en ganciclovir triphosphate a été mis en évidence dans des cellules infectées par le HSV et le CMV, avec des demi-vies respectives de 18 heures et 6 à 24 heures, après élimination du ganciclovir extracellulaire. Comme la phosphorylation est largement dépendante de la kinase virale, la phosphorylation du ganciclovir se produit préférentiellement dans les cellules infectées par le virus.
Omzetting in ganciclovir trifosfaat werd aangetoond in met HSV en CMV besmette cellen, met een halfwaardetijd van resp. 18 uur en 6 tot 24 uur, na eliminatie van het