Environ 2/3 d’une dose unique de clomipramine sont excrétés sous forme de conjugués hydrosolubles dans les urines et environ 1/3 dans les selles. Les quantités de clomipramine et de déméthylclomipramine s’éliminant par voie urinaire sous forme inchangée, s’élèvent respectivement à environ 2 % et 0,5 % de la dose administrée.
De hoeveelheid onveranderd clomipramine en desmethylclomipramine die via de urine geëxcreteerd wordt, bedraagt respectievelijk, ongeveer 2% en 0.5% van de toegediende dosis.