L’aciclovir possède une affinité 10 à 20 fois plus élevée par rapport à l’ADN polymérase virale que par rapport à l'ADN polymérase cellulaire; dès lors, l’activité de l’enzyme virale est inhibée de manière sélective.
Aciclovir heeft een affiniteit voor viraal DNA polymerase die 10-20 maal hoger is dan die voor cellulaire DNA polymerase en daardoor wordt de werking van het virale enzym op selectieve wijze geremd.