Un certain nombre d’exceptions sont reprises dans la législation : par exemple, les plantes reproduites artificiellement peuvent être commercialisées, et cela quelle que soit l’Annexe à laquelle elles appartiennent.
Verder zijn er wel een aantal globale uitzonderingen opgenomen in de wetgeving: gekweekte planten, ongeacht de bijlage waarin ze zijn opgenomen, mogen bijvoorbeeld vrij verhandeld worden.