Etant donné que la zopiclone est métabolisée par le CYP3A4, les taux plasmatiques de la zopiclone et, par conséquent, son effet peuvent être augmentés en cas d’utilisation en association avec les inhibiteurs du CYP3A4, tels que les antibiotiques macrolides, les antimycosiques azolés et les inhibiteurs de la protéase du VIH, tout comme le jus de pamplemousse.
Aangezien zopiclon gemetaboliseerd wordt door CYP3A4, kunnen de plasmaspiegels van zopiclon en dus ook het effect van zopiclon verhoogd zijn, indien gebruikt in combinatie met geneesmiddelen die CYP3A4 remmen, zoals macrolide antibiotica, azoolantimycotica en HIV-proteaseremmers alsook pompelmoessap.