Parfois, des divergences de réglementation, par exemple intermodales, intraportuaires ou interportuaires rendent malaisé le développement des TVN. Trop souvent des procédures découlant d'une législation non directement reliée aux transports, par exemple les directives relatives aux déchets, à la sécurité alimentaire ou à l'environnement, posent des problèmes bureaucratiques considérables au secteur des transports par voies navigables.
Het komt al te dikwijls voor dat procedures van wetgeving die niet rechtstreeks in verband staat met het transport, bvb richtlijnen op afvalverwerking, voedselveiligheid of milieubescherming, voor de binnenscheepvaart enorme administratieve problemen opwerpen.