Het Europees Parlement was altijd gekant tegen dit systeem van comitologie, zowel om politieke redenen (gebrek aan transparantie) als om redenen van institutioneel evenwicht en scheiding der machten, aangezien de communautaire wetgever, de Raad, tevens uitvoeringsbevoegdheden voor zijn rekening neemt.
Das Europäische Parlament war sowohl aus politischen Gründen (Mangel an Transparenz) als auch aus Gründen des institutionellen Gleichgewichts und der Gewaltenteilung - auch der gemeinschaftliche Gesetzgeber, der Rat, übt Exekutivbefugnisse aus - immer ein Gegner der Komitologieregelung.