De eis van onafhankelijkheid staat geen audits door inhouse-deskundigen in de weg, op voorwaarde dat deze gekwalificeerd of geaccrediteerd zijn, dat zij niet direct bij de gecontroleerde activiteit betrokken zijn en dat de lidstaat een regeling heeft ingesteld om hun bekwaamheid te garanderen en te controleren en indien nodig sancties op te leggen.
Die geforderte Unabhängigkeit ermöglicht eine Durchführung der Audits durch interne Experten, sofern diese qualifiziert oder akkreditiert und nicht unmittelbar in der Tätigkeit, die Gegenstand des Audits ist, beschäftigt sind, und sofern der betreffende Mitgliedstaat ein System eingeführt hat, um ihre Qualität sicherzustellen und zu überprüfen und gegebenenfalls Sanktionen zu verhängen.