In haar mededeling over de financiering van Natura 2000 erkent de Commissie dat de kosten voor het beheer van Natura 2000 € 6,1 miljard bedragen, waarvan € 5 miljard voor de 15 "oude" lidstaten en € 1 miljard voor de tien nieuwe.
In ihrer Mittelung über die Finanzierung von 2000 anerkennt die Kommission, dass sich die Kosten der Bewirtschaftung des Natura-2000-Netzes auf 6, 1 Milliarden Euro belaufen: 5 Milliarden Euro in den 15 alten Mitgliedstaaten und eine Milliarde Euro in den zehn neuen Mitgliedstaaten.