De Commissie omschrijft de doelstelling van het tweede specifieke programma in het kader van het zesde OTO-kaderprogramma als volgt: "gericht op een aantal fundamentele structurele zwakten die aan het licht treden op alle gebieden van het Europese onderzoek en die, naar mate de economie en de samenlevingen in de EU-landen in toenemende mate kennisgebaseerd worden, steeds duidelijker effecten hebben op het vermogen van de EU om tegemoet te komen aan de verlangens van haar burgers".
Die Kommission definiert das Ziel des zweiten spezifischen Programms im Zusammenhang mit dem 6. FTE-Rahmenprogramm als Beseitigung einer Reihe von wichtigen strukturellen Schwachstellen, die in allen Bereichen der europäischen Forschung auftreten und die wahrscheinlich immer bedeutendere Auswirkungen auf die Kapazität der EU haben, die Erwartungen ihrer Bürger zu erfüllen, während ihre Volkswirtschaften und Gesellschaften mehr wissensbasiert werden.