De belangrijkste argumenten tegen het MDO-model zijn hoofdzakelijk gebaseerd op de onnauwkeurigheid van de gegevens, aangezien geen rekening wordt gehouden met substantiële veranderingen in de structuur van het bestand. Als deze veranderingen optreden, vervalt het gebruik ervan als referentiepunt, aangezien de afwijking van de werkelijke waarden kan leiden tot overbevissing.
Die wichtigsten Argumente, die gegen das MSY-Konzept sprechen, sind die Ungenauigkeit der Daten, weil bestimmte strukturelle Änderungen des Bestandes, die aber von wesentlicher Bedeutung sind, nicht berücksichtigt werden.