Tot slot wordt verwacht dat de ERA-NET-projecten zullen leiden tot een grote mate van samenwerking, ook wat betreft strategische planning en de opzet van gezamenlijke onderzoeksprogramma's, de wederzijdse openstelling van nationale onderzoeksprogramma's voor onderzoekers uit andere lidstaten, de organisatie van gezamenlijke uitnodigingen tot het indienen van voorstellen en de start van gezamenlijk gefinancierde volledig transnationale programma's.
En dernier ressort, les projets ERA-NET doivent déboucher sur une collaboration approfondie recouvrant notamment la planification stratégique et l'élaboration de programmes de recherche communs, l'ouverture réciproque des programmes de recherche nationaux à des scientifiques d'autres pays membres, l'organisation d'appels de propositions conjoints, et le lancement de programmes réellement transnationaux financés en commun.