In tegenstelling tot wat de Ministerraad betoogt, is het tweede middel niet afgeleid uit de aanmatiging, door de federale wetgever, van een gemeenschapsbevoegdheid, maar uit de schending van het evenredigheidsbeginsel : de wijze waarop de federale wetgever de hem toekomende aspecten van de « peer review » heeft geregeld, maakt het de gemeenschappen onmogelijk de hun toekomende aspecten nog zinvol te behartigen.
Contrairement à ce que soutient le Conseil des ministres, le deuxième moyen n'est pas pris de l'appropriation d'une compétence communautaire par le législateur fédéral mais de la violation du principe de proportionnalité : la manière dont le législateur fédéral a réglé les aspects du « peer review » qui lui incombent empêche les communautés de gérer convenablement les aspects qui leur reviennent.