Omdat corruptie vaak het staatsapparaat zelf heeft aangetast, is het mogelijk dat de Commissie, wanneer zij op basis van regionale instrumenten of de Overeenkomst van Cotonou over nationale programma's onderhandelt met de regeringen van derde landen, er niet in slaagt om op dit vlak volledig tevredengesteld te worden.
La corruption étant souvent au cœur de l'appareil d'État, il se peut que la Commission, lorsqu'elle négocie les programmes nationaux avec les gouvernements des pays tiers sur la base des instruments régionaux ou de l'Accord de Cotonou, ne parvienne pas à obtenir pleinement satisfaction dans ce domaine.