Le fluconazole présente une plus grande sélectivité pour les enzymes fongiques dépendant du cytochrome P450 que pour différents systèmes enzymatiques mammifères régis par le cytochrome P450.
Het is aangetoond dat fluconazol selectiever is voor cytochroom P450-enzymen van fungi dan voor cytochroom P450-enzymsystemen van verschillende zoogdieren.