La Commission des Thons de l'Océan Indien (CTOI), chargée de la gestion des populations de seize espèces migratoires (principalement des thonidés) dans cette région, a estimé que les stocks de thon jaune, de thon obèse et d'espadon sont en pleine exploitation et que les stocks de bonites à ventre rayé sont sous-exploités.
Volgens de Commissie voor de tonijnvisserij in de Indische Oceaan (IOTC), die verantwoordelijk is voor het beheer van de bestanden van de zestien migrerende soorten (voornamelijk tonijnsoorten) in deze regio, worden de bestanden geelvintonijn, grootoogtonijn en zwaardvis ten volle geëxploiteerd, terwijl het bestand gestreepte tonijn nog onderbevist is.