Le cis(Z)-flupentixol possède une haute affinité pour les récepteurs α1-adrénergiques en 5-HT2 (qui est toutefois moindre que celle du chlorprotixène, des phénothiazines à dose élevée et de la clozapine), mais pas d’affinité pour les récepteurs cholinergiques muscariniques.
Cis(Z)-flupentixol heeft een grote affiniteit voor α1-adrenoreceptoren en 5-HT2 receptoren (doch lager dan die van chloorprothixeen, hoge doses fenothizines en clozapine), echter geen affiniteit voor de cholinerge muscarine receptoren.